وتشمل الآليات الأخرى المنشأة عملا باتفاق السلام الشامل المفوضية القومية للبترول ولجنة الحدود ولجنة حدود أبيي والمفوضية القومية المعنية بالجهاز القضائي ولجنة الخدمة المدنية. 根据《全面和平协定》设立的其他机制包括国家石油委员会、特设边界委员会、阿卜耶伊边界委员会、国家司法事务委员会和公务员制度委员会。
وإلى جانب الاتفاق على انسحاب جميع عناصر القوات المسلحة والجيش الشعبي والقوات المتحالفة مع كل منهما من منطقة أبيي، اتفق الطرفان أيضاً على أن يُحيلا النزاع الأساسي المعلق بشأن نتائج لجنة حدود أبيي إلى محكمة التحكيم الدائمة في لاهاي للبت فيه. 除了商定从阿卜耶伊撤出所有苏丹武装部队、苏人解和代理军，各方也同意由海牙常设仲裁法庭裁决关于阿卜耶伊边界委员会调查结果的未决基本争端。
وأنشأ بروتوكول أبيي الملحق باتفاق السلام الشامل لجنة حدود أبيي، التي كان يفترض أن يكون قرارها " نهائيا وملزما " ، إلا أن حكومة السودان رفضت التقرير الصادر عنها. 《全面和平协议》阿卜耶伊议定书设立了阿卜耶伊边界委员会，其决定将是 " 最终和有约束力的 " ，但该委员会的报告遭到苏丹政府的拒绝。
ونتيجة لذلك، لم يحرز سوى تقدم محدود بشأن الجوانب الأساسية من بروتوكول أبيي المرفق باتفاق السلام الشامل، عقب قيام حزب المؤتمر الوطني برفض النتائج التي خرجت بها لجنة حدود أبيي، ورفض مجموعات المسيرية لقرار محكمة التحكيم الدائمة، وعدم اكتمال تنفيذ الأحكام المتعلقة بتقاسم الثروة. 因此，由于全国大会党拒绝阿卜耶伊边界委员会的结论、米塞里亚族拒绝常设仲裁法院的裁决和财富共享规定未得到全面执行，在执行《全面和平协定阿卜耶伊议定书》的核心内容方面鲜有进展。
وتدّعي بعض الشخصيات في الجيش الشعبي أن منطقتي هجليج وكرسانة الغنيتين بالنفط تدخلان ضمن المناطق المتنازع عليها، مستندة في ذلك إلى أن تلك المناطق أدرجت في القرار الذي تقدمت به لجنة حدود أبيي في عام 2005، وإلى رفض قبيلة المسيرية حكم محكمة التحكيم الدائمة في هذا الصدد. 由于Higlig和Kharasana这两个石油丰富的地区已纳入阿卜耶伊边界委员会2005年作出的决定，并且由于米塞里亚人拒不接受常设仲裁法院的裁决，苏人解的一些人士声称这两个地区是有争议的地区。